故事的核心圍繞著金剛治果島的命運展開。這座島嶼是北歐神話中兩位神明，雷神托爾與洛基的家園，也因此蘊含著巨大的力量，吸引著眾多想要獲得神力的勢力。

主角們，以藤丸立香為首的Fate/Grand Order團隊，被召喚到這個島嶼，肩負著阻止島嶼沉沒的使命。然而，他們面臨的並非簡單的自然災害，而是源自於北歐神話中神明間的衝突，以及人類與神明之間的隔閡。

劇情快速推進，展現了北歐神話中諸位神明鮮活的形象：雷神托爾的強大與衝動，洛基的狡猾與智慧，以及其他神明各自的立場與目的。島嶼上的生物，無論是神獸還是人類，都深受這場衝突的影響，命運交織，危機四伏。

動畫將戰鬥場景表現得淋漓盡致，各個Servant的寶具都各有特色，配合華麗的特效和緊張的配樂，令人熱血沸騰。然而，戰鬥之外，動畫也著重描繪了角色之間的羈絆與成長。例如，奧丁與弗蕾雅之間的複雜關係，以及主角團成員在面對困境時，如何互相扶持，共同前進。

關鍵劇情轉折在於對「聖約」的理解。原本以為「聖約」是神明與人類之間的承諾，但在故事的深入發展中，卻發現「聖約」更像是一種維持世界秩序的枷鎖，束縛著神明與人類的自由。打破「聖約」，也許意味著新的希望，但也可能帶來毀滅性的後果。

動畫在第41集的部分，集中展現了主角團與各個神明的最終對決。面對強大的敵人，他們必須做出艱難的選擇，承擔沉重的責任。最終，主角團能否成功阻止島嶼沉沒，拯救金剛治果島的命運？而他們與神明之間的關係，又將走向何方？這些問題都將在後續劇情中揭曉。

總而言之，這部動畫不僅僅是一部簡單的戰鬥番，它更深刻地探討了神話、命運、自由與責任等主題，引發人們對世界的思考。